【全球快播报】Python 读取 .gz 文件全过程
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Python 读取 .gz 文件Python 读取gz文件,字符串与字节串的相互转换Python 读取 .gz 文件
读取.gz 文件需要使用gzip 包,如果没有安装可以自行在终端安装
pip install gzip
import gzip path = "" #你的文件路径 f = gzip.open(path, "rb") for line in f.readlines(): # 按行进行读取 s = line.decode() # 读取之后要进行解码 print(s) # s 为string类型,就是我们读取的文件中的一行
也可以批量读取,批量读取文件使用os包对文件夹中的所有文件进行
import gzip import os\ path = "" #表示你要打开的文件夹 files = os.listdir(path) #files 是path中存放的所有文件名集合 for file in files: f = gzip.open(path+file, "rb") for line in f.readline(): print(line)
Python 读取gz文件,字符串与字节串的相互转换
首先是字节串转字符串,也就是str:
b = b"some byte array" str(b, encoding = "utf-8") #or bytes.decode(b)
然后是字符串转为字节串:
s = "some string" bytes(s, encoding = "utf8") #or str.encode(s)
fastq.gz文件读取
with gzip.open(fq,"r") as fastq: try: while True: line1 = next(fastq).decode() # 字节转字符串 line2 = next(fastq).decode() line3 = next(fastq).decode() line4 = next(fastq).decode() except: pass
以上为个人经验,希望能给大家一个参考,也希望大家多多支持脚本之家。
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